Хола Амиго, с вами Леона Йона! Продолжаем проходить игру Prototype, где нашим героем будет Алекс Мерсер, человек-мутант, способный изменять своё тело и превращать руки в оружие, а кожу в броню. Он потерял память и пытается выяснить, что же с ним произошло, а заодно и отомстить тем, кто превратил его в мутанта.