После похищения, Босс просыпается в прошлом. Прошлым является Стилпорт в 50-тые годы. Через какое-то время, он идёт к машине, рядом с которой стоит полицейский, Они едут в кафе, чтобы пообщаться с лучшими людьми Стилпорта. До приезда в кафе, Босс понимает, что тут происходит что-то странное. Приехав в кафе, он начинает знакомится с людьми. Поняв, что он ненастоящий человек, а часть симуляции, он проматерился на всё кафе. Полицейский сказал, что так в Стилпорте не выражаются. Уехав на машине, Босс услышал Кинзи. Она сказала, что он находится в симуляции и что ему нужно выбраться. Приехав в парк, он начал устраивать хаос для того, чтобы выбраться отсюда. Но побег провалился, дальше появляется Зиньяк и говорит, что если он попытается убежать, то он взорвёт планету. Дальше Зиньяк бросает Босса в симуляцию Стилпорта. Кинзи говорит, что нужно ознакомиться с симуляцией, для того чтобы выбраться отсюда. Дальше идут вступительные задания. Босс постепенно будет получать суперсилы. После выполнения всех вступительных заданий, Кинзи говорит, что можно бежать. После Босс входит в портал, который освобождает его. После освобождения, Босс попадает на корабль пришельцев, он продвигается до платформы, где его должны были забрать Кит Дэвид с Кинзи Кенсингтон. Успешно убежав, Босс начинает управлять кораблём. После того, как они выбрались, они летят на землю. Кинзи позвонила Олегу, чтобы предупредить его. В этот момент Зиньяк взрывает Землю. Святые возвращаются в Империю Зин, чтобы освободить своих друзей. По ходу сюжета Святые встречают цифровую копию человека, который говорит, что он может помочь спасти его друзей. Они ему помогают и он получает форму для жизни, которую называют УКС и он становится частью Святых. Дальше Босс попадает в симуляции своих друзей для того, чтобы их спасти. Симуляции его друзей (в том числе и симуляция Босса) основана на самых страшных воспоминаниях в головах друзей. После спасения Мэтта Миллера, он находит тюрьму в виде самолёта. Босс начал перечислять тех, кто был там и пришёл к выводу, что Джонни Гэт жив. Отправившись в эту тюрьму, они увидели, что это не кошмар Гэта, а кошмар Шаунди. После того, как он попал в прошлое, они увидел Шаунди из Saints Row 2. После того, как Шаунди была спасена, Святые начали спасать остальных Святых: Бенджамина Кинга, Ашу Одекар и Пирса Вашингтона. После спасения всех, Босс решился на вторую попытку спасти Джонни Гэта. Босс попадает в симуляцию, где он должен спасти жену Гэта, Аишу. Смерть Аиши было самым ужасным воспоминаем в голове Гэта. После того, как в мини-игре Гэт с Боссом спасли Аишу, он проснулся и вспомнил, что Аиша умерла. После того, как Босс освободил Гэта, он полетел в империю, чтобы спасти Гэта. Спасение проходит успешно. На корабле он рассказывает, как он попа?